ПаиПал је једна од ретких платформи за плаћање која нема правих негативних тачака, јер не пати од проблема са временом трансакције или ограниченог прихватања као што је други е-новчаници. Једини проблем који ПаиПал често има је то, за казина уживо на бројним локацијама широм света, ограничена је локалним правилима о обради плаћања. У ретким случајевима, ово може учинити ПаиПал недоступним за коришћење на било који начин, иако је ово и даље много мањи проблем него што је за друге платне платформе.
Остали проблеми могу укључивати:
- Накнаде за трансакције велике вредности.
- Потенцијал за замрзавање налога на основу њиховог интерног безбедносног скенирања.
- Нема могућности анонимног коришћења платформе.